با الهام از تعالیم دینی، واحد قرض‌الحسنه مؤسسه در سال ۱۳۷۸ تأسیس شد تا بخشی از نیازهای مالی خانواده‌های محروم را تأمین نماید و تاکنون به بیش از ۱۵۰۰ نفر وام قرض‌الحسنه اعطا شده است. منابع مالی این واحد از کمک‌های خیرین تأمین شده که  در صورت درخواست سرمایه‌گذاران، اصل سرمایه با احترام به آنان بازگردانده خواهد شد.
 فعالیت‌های واحد قرض الحسنه
* شناسایی متقاضیان واجد شرایط با همکاری واحد تحقیق و بررسی
* اعطای وام‌های بلندمدت و کوتاه‌مدت
* نظارت بر عملکرد صندوق
* دریافت تضامین معتبر برای بازپرداخت
* جذب کمک‌های مردمی
* ارائه گزارش‌های ماهانه
در این بخش با اعطای وام، مشکلات بسیاری از نیازمندان رفع گردیده و زمینه اشتغال افرادجویای سرمایه و کمک هزینه زندگی هم فراهم شده است.
از آنجاییکه طبق روایات ثواب قرض الحسنه 18 برابر صدقه هست، همچنان از نیکوکاران تقاضامندیم در این بخش سرمایه گذاری نمایند تا به افراد نیازمند زمینه اعطای وام های بیشتری در جهت تولید و ایجاد شغل و غیره فراهم گردد.

* رسول خدا صلى ا… عليه و آله و سلم فرمود: هرکس به مؤمنى قرض بدهد و منتظر بماند تا قرض گيرنده گشايش (در كارش) يابد، آن مال ثواب زكات خواهد داشت و قرض دهنده مورد درود فرشتگان باشد تا آنكه قرض گيرنده قرضش را ادا نمايد.